港大研发污水检测新冠病毒新方法 快速鉴定变种病毒

2021-07-04 20:47

港大研发一种基于突变基因的RT-qPCR技术的新检测方法以快速分辨不同的变种病毒。
港大研发一种基于突变基因的RT-qPCR技术的新检测方法以快速分辨不同的变种病毒。

香港大学工程学院土木工程系开发新的污水检测新冠病毒方法,并自去年12月起被用作公共衞生防控手段,污水监测结果协助政府发出强检令来追踪在社区潜在的新冠病毒感染者。现时全港有超过100个常规污水检测点,覆盖超过500万人口。  

团队日前成功研发了一种基于突变基因的RT-qPCR技术的新检测方法以快速分辨不同的变种病毒。新方法使用团队自己设计和文献中发表的引物 - 探针以检测新冠病毒刺突蛋白的不同突变位来确定变种类型。与基因排序相比,这种新方法通常能于非常短时间内(几个小时),对变种病毒进行快速鉴定,以便衞生当局跟进行动。

港大用探针以检测新冠病毒刺突蛋白的不同突变位来确定变种类型。
港大用探针以检测新冠病毒刺突蛋白的不同突变位来确定变种类型。

新的污水变种检测方法近日应用于大埔常规采样点在6月21日收集的一个污水样本,成功测出Delta变种病毒株的阳性信号。该处于6月23日发现涉及Delta突变株的初步确诊个案,并于6月25日下午通过基因排序确定是Delta变种病毒。污水检测早于该变种个案有初步阳性结果的前一天,便给出了Delta变种病毒在社区污水出现的预警;比利用确诊个案的病毒基因排序确认变种类型,提前了3天。

张彤认为,新方法进一步证实了突变基因特异性的RT-qPCR技术用于快速检测污水中病毒变种类型的可行性。研究团队正在与政府进一步紧密合作,选择更合适的污水采样时间,优化样本前处理程式,提高采样和检测能力,开发新变种检测的新方法,并整合临床和流行病学数据,进一步将污水监测系统发展成一个更强大的系统。

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