城大研细胞3D影像系统助治癌

2021-01-03 22:41

严洪(左)及曹剑锋。城大图片
严洪(左)及曹剑锋。城大图片

细胞分裂期间,如能清晰撷取细胞影像,有助分析其形成、结构及功能。城市大学科学家研发崭新电脑软件,能可协助生物学家将秀丽隐杆綫虫胚胎重构并影像化,显示胚胎的三维影像及形态变化。技术将有助更深入了解癌症及找出可行疗法。

研究由城大、浸会大学及北京大学的学者共同领导。城大研发的电脑系统框架名为CShaper,可协助生物学家将秀丽隐杆綫虫胚胎重构并影像化,显示胚胎的三维影像及形态变化。团队同时研发一套名为DMapNet的深度学习方法,以划分胚胎膜,在秀丽隐杆綫虫胚胎4至350个细胞的不同阶段,制作时序三维细胞形态变化图。

相比起未能清楚显示细胞膜的旧有影像分析系统,新系统可准确侦测到细胞膜,并追踪细胞,重构细胞的三维形状,协助科学家分析细胞特点,包括细胞分裂期间的形状、细胞与细胞之间的接触和通讯,以及基因与蛋白质的功能。

电机工程学系电脑工程学讲座教授兼黄俊康教授(数据工程)严洪指,由于秀丽隐杆綫虫胚胎与人类的主要生物特性相近,可作为研究人体内肿瘤生长过程的重要模型。电机工程学系博士生曹剑锋亦指,新技术诠释胚胎影像所需的时间。由数百小时大幅减少至数小时,彻底改变生物学家检查实验数据的方法。

三维细胞影像(左)及细胞划分后的图像(右)。城大图片
三维细胞影像(左)及细胞划分后的图像(右)。城大图片

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