星岛日报

【毕业生故事】IVE毕业生研发泥土DNA检测 辨别树木真菌 及早缉拿塌树元凶

2020-10-26 14:02
IVE(柴湾)应用科学系高级讲师卢廷诗(右)与IVE生物科技高级文凭毕业生何耀忠(左)参与研发采集泥土样本快速鉴定树木真菌品种的DNA检测方法。
IVE(柴湾)应用科学系高级讲师卢廷诗(右)与IVE生物科技高级文凭毕业生何耀忠(左)参与研发采集泥土样本快速鉴定树木真菌品种的DNA检测方法。

台风「浪卡」早前袭港,天文台更预告不排除下月仍会出现台风。台风来袭除有机会引致水浸,亦会引发树木倒塌等问题。若树木感染真菌,则更易腐朽和变得脆弱,难以抵强风,造成塌树意外。五名热爱植物科学的香港专业教育学院(IVE)生物科技高级文凭毕业生,便利用生物科技缉拿塌树元凶。他们改良现时快速鉴定树木真菌品种的DNA检测方法,以及早预防、诊断和治疗受感染的树木。项目早前于职业训练局(VTC)主办的「创意x应用」计划中夺「卓越大奬」。

为辨别树木受感染的真菌品种,以便对症下药,现时树艺师主要以目测方法辨识,或将菇菌及其孢子交由实验室检测。然而依靠肉眼辨别的传统方法,一来不够准确,二来要待真菌长成菇时,才能辨识问题,已错过治疗最佳时机。

若树木感染真菌,或会在树表面长出菇,为辨别树木受感染的真菌品种,树艺师主要以目测方式查看菇的类型,或将菇菌及其孢子交由实验室检测。
若树木感染真菌,或会在树表面长出菇,为辨别树木受感染的真菌品种,树艺师主要以目测方式查看菇的类型,或将菇菌及其孢子交由实验室检测。

取得泥土中的真菌DNA 判辨真菌品种

「由于部分高危真菌在长成菇菌前,已对树木结构造成一定破坏。因此,我们想尽早得知树木受哪种真菌感染,遂研究以泥土检验方法取得真菌的脱氧核糖核酸(DNA),以及早判断真菌种类。」IVE生物科技高级文凭毕业生邹俊杰解释研究目的。他于IVE读书时,夥拍另外四位同学欧家杰、程浩钿、林逸华和何耀忠展开此研究。邹俊杰指,团队从泥土样本取得真菌DNA后,再利用分子生物技术复制并检测泥土中真菌DNA的序列,然后与基因资料库中的真菌DNA序列作对比,从而分析存在于泥土中的真菌品种。

屡败屡试 约半年完成逾500次试验

研究团队成员之一家杰指,研发期间经历不少挑战,如由于泥土含有不少化学物质会阻碍分子诊断,团队于是参考大量文献,发现在复制DNA过程中加入「纳米金粒子」,能将复制DNA的灵敏度提升十倍,有助解决泥土中杂质带来的假阴性问题,提升测序成功率达三成。另一成员耀忠分享:「过程中最具挑战的部分在于找出检测过程中『纳米金粒子』的合适份量和浓度等。我们花近半年时间,利用不同泥土样本完成超过500次测试,才能确保测试的准确性」。

IVE生物科技高级文凭毕业生何耀忠指,团队提取泥土中真菌的DNA,再利用分子生物技术复制并检测DNA的序列,从而分析存在泥土中的真菌品种。
IVE生物科技高级文凭毕业生何耀忠指,团队提取泥土中真菌的DNA,再利用分子生物技术复制并检测DNA的序列,从而分析存在泥土中的真菌品种。

发现潜在令树木腐朽的真菌品种

团队研发的检测方法,除可准确检验普遍存在于泥土里的真菌外,亦能验出一些可能引致树木腐朽的真菌品种,包括Trametes cubensis(古巴栓孔菌)及Ganoderma gibbosum(有柄树舌灵芝)等。负责带领学生进行今次研究的IVE(柴湾)应用科学系高级讲师卢廷诗表示,现时业界较少利用泥土来检测树木真菌,未来学系将继续改良技术,提升其灵敏度,冀望技术日后可应用于树艺及检测业界。

现已升读本地大学自然科学相关学士学位课程的俊杰指,研发过程让他应用于IVE所学:「包括分子生物学、微生物学和细胞培养等知识;遇到困难时,除参考文献,我们亦请教树艺师和院校导师等。」此外,俊杰于IVE读书时,亦曾获院校安排到新加坡国立癌症中心实习,获取实战经验。俊杰希望日后在植物科学研究上继续钻研,贡献社会。

资料来源:VTC

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